As raízes da Associação remontam a Maio de 1940 quando foram aprovados, por alvará daquela data, os estatutos do Grémio Concelhio dos Comerciantes de Instrumentos de Precisão, Cirurgia e Óptica de Lisboa, um dos 29 Grémios que se integraram na União de Grémios de Lojistas de Lisboa, sucessora da Associação Comercial de Lojistas de Lisboa, fundada em 1 de Janeiro de 1870 e reconstituída a 14 de Fevereiro de 1894, e que se transformou, após a Revolução de Abril de 1974, na União das Associações de Comerciantes de Lisboa, cuja designação, após a alteração estatutária, é actualmente de União das Associações do Comércio e Serviços (UACS).
O Grémio Concelhio dos Comerciantes de Instrumentos de Precisão, Cirurgia e Óptica de Lisboa manteve essa designação de 1940 a 1975, tendo sido transformado em Associação dos Comerciantes de Equipamentos Científicos do Distrito de Lisboa, mediante novos estatutos aprovados e publicados em Diário do Governo de 16 de Setembro de 1975. Ainda no tempo do Grémio a actividade óptica constituiu o Grémio Nacional dos Ópticos, hoje Associação Nacional dos Ópticos.
Em Dezembro de 1996 foi aprovada em Assembleia Geral Extraordinária a alteração dos respectivos estatutos, tendo o seu âmbito geográfico sido alargado de distrital para nacional, enquanto a sua designação passou a ser a que agora tem Associação Nacional dos Comerciantes de Equipamentos Científicos, Saúde e Imagem.
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